Srpske snage potom su poravnale temelje u ratu porušene prve župne crkve i nijekali da je na tom mjestu ikada bila crkva
Na današnji dan, 28. listopada 1992. godine, srpska vojska miniranjem je srušila katoličku crkvu sv. Ilije u Bosanskom Brodu. Novu crkvu na temeljima stare posvetio je kardinal Vinko Puljić 2014. godine.
Do tada se sveta misa služila u podrumu župnog stana.
Kada je srpska vojska 6. listopada 1992. ušla u Bosanski Brod, katolička crkva sv. Ilije bila je pogođena granatom u visini početka zvonika. Nakon što su bogomolje – džamija i crkva – snimljene i vijest o tome obišla svijet riječju i slikom, srpske su snage sravnile sa zemljom obje bogomolje.
Potom su srpske snage poravnale temelje u ratu porušene prve župne crkve i nijekali da je na tom mjestu ikada bila crkva. Otkopavanjem temelja istina je izašla na vidjelo, a nova crkva sagrađena je na istim temeljima i prema istom projektu.
U općini Bosanski Brod prije rata živjelo je 35.000 stanovnika. Hrvati su činili 41 posto stanovništva, Srbi 33 posto, a Bošnjaci 12 posto. U gradu Bosanskom Brodu Hrvati su činili 57 posto stanovništva, Bošnjaci 20 posto, a Srbi 15 posto.
Rušenje crkve sv. Ilije bilo dio je šireg razaranja katoličke sakralne baštine tijekom rata u Bosni i Hercegovini. Prema podacima Katoličke Crkve, tijekom rata potpuno je uništeno 269 katoličkih vjerskih objekata, dok je još 731 objekt oštećen.
